本系前身是商業自動化中心，乃本校配合教育部製商整合計畫而建置的一個單位。在92學年度本系成立之初，名稱是商業自動化與管理系，以產業電子化（e-business）的教學為主，並在不同階段檢視學系的發展方向，必要時調整學系的定位與發展策略。目前，日夜間部共計8班，教師11位。自創系以來，本系同仁莫不堅守教學崗位、積極作育英才、戮力以赴。

從92學年到95學年，本系主要是配合經濟部商業司對於商業自動化及電子化發展之建議，進行課程設計，同時建立了一個全校性的產業電子化學程，後來更名為產業e化模組。96學年度起，本系因應科技創新與服務趨勢，逐步調整教學重點，並於98學年度，更名為商務科技管理系，開設新興科技導入及應用的智慧科技模組，以及以服務創新為主的創新管理模組。之後更於99學年度建置了一個全校性的「跨領域創意創新創業學分學程」，並通過校內學分學程評鑑。此一學程希望為同學們帶來一些工具與觀念，協助同學們持續追求及培養自己的創意與創新能力，同時具備創業規劃能力與正確的創業認知。

本系連續兩次獲得教育部評鑑一等，並通過最近一次認可制的校內自評。然而，過去佳績只是基石，惟有不斷檢視才能永續；因此，本系於102學年配合校內自評，再度通盤審視環境趨勢與變化以及自身的資源與能耐，進行未來的發展規劃。首先，配合教學卓越計劃的文創人才培育以及學群定位由資訊轉變為創新設計的改變，本系開始將科技工具與創新方法運用在文創產業，建置了全校性的「文創科技學分學程」，並承接一些相關的產學合作；之後，本系於103學年進行課程與模組再造，經過多次討論，確認本系能耐在於資訊、科技、服務與創新，對於文創產業只能從旁協助，無法成為主要發展重點，故決定以含蓋面較廣的資通科技以及服務創新為方向，精簡但深化各課程與教學。自104學年起，本系模組將由三個減為二個，包括整併之前的智慧科技模組與部份產業e化模組的內容，成為資訊科技應用模組，同時整併之前的創新管理模組與部份產業e化模組內容，成為新的服務創新模組，希望這樣的轉變能夠符應未來四到八年的環境變化，培養社會需要的人才。